Как заполнить декларацию по НДС при аренде муниципального имущества, если арендная плата не перечислялась?

Добрый день!
Наша организация на УСН арендует муниципальное имущество с апреля 2016 г. В связи с этим мы являемся налоговым агентом по НДС, обязаны исчислить, удержать и перечислить в бюджет НДС с арендной платы в размере 18%. За 2 квартал сдали декларацию по НДС. А в 3 квартале перечислений по аренде не было, т.е. налог не исчислен и не удержан, хотя договор действует. За 3 квартал аренда перечислена с опозданием в начале октября. Вопрос такой - нужно ли сдавать нулевую декларацию по НДС за 3 квартал, т.к. налог к уплате не возникает? Пыталась отправить нулевую декларацию по ТКС, декларация не принимается, ошибка "при представлении декларации налоговым агентом сумма к уплате должна быть заполнена". Не будет ли штрафа, подскажите? Желательно со ссылкой на НМА. Спасибо!